在很久以前,人类全都是住在海里的,可是,憧憬着陆地的人类最终抛弃了大海,他们脱去了那层海神所赐予的,能够让他们在海里生活的「胞衣」。登上陆地的那些人遭受了种种的困难,日照持续不断,寻找水源的人类开始不断的互相争斗。有些人把这些恶果归结为「海神发怒了」的缘故,所以他们会把作为祭品的少女放在船上,让其漂流向大海,这就是「舟曳祭」的来源。人鱼与人相互认识后,献祭品不是活人,而是米、点心之类的东西。相传生活在海里的水族,是海神与被献祭的少女繁衍下来的子孙。由于水底学校关闭而被迫转入地上中学的爱花四人,在开学第一天邂逅了海边渔民家的孩子木原纺,一系列关于青春的故事就此开始。