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2012年9月,一篇题为《中国北方古代人群Y染色体遗传多样性研究》的博士论文,涉及了古匈奴人骨的基因鉴定成果。
研究人员在新疆东天山哈密地区墓地的古代人骨标本中,测到了比例不低的男性Y染色体Q1b类型,这个基因类型被认为是高加索白种人类型,且在印度、西亚、中亚、欧洲(特别是德系犹太人)中普遍存在,尤为重要的是,它高频出现于西伯利亚的孤立语族叶尼塞民族,这与有些专家推测匈奴为叶尼塞语族的论点吻合。
而黑沟梁遗址通常被认为与西匈奴有关。青铜时代至铁器时代早期,也即相当于中原夏商周时期的东天山地区古代遗存,有很强的地域性特征,目前确定的土著文化,包括天山北路文化和其后的焉不拉克文化。
黑沟梁遗址所属的巴里坤草原,曾有焉不拉克文化寒气沟类型,可延续到西汉之初,此时,游牧于此的古代民族当为月氏。