经过三关鏖战的玩家，能撑到第四关是非常不错的了。进入第四关后，游戏难度又提升了一个度，主要原因在于房间陷阱增多、怪物数量增多、怪物攻击方式发生变化。
迄今为止，《元能失控》的关卡特色十分明显，第二关为毒液，第三关为冰面，第四关为电磁。陷阱也变为激光陷阱和电磁发射器，在电磁机关周围呆久了，角色会受到电击，护盾被电磁清空；怪物新增弹幕攻击。
这时，+3的武器打怪物开始缺少输出，如果没有攻击和暴击芯片的加成，打怪只能慢慢磨血。但也不用太担心，到第四关会固定出现强化武器的铁匠，可以供我们升级武器、强化武器（增加词缀）。