冬虫夏草在土壤里的生长过程中，体表尤其是皱褶内粘附了大量泥沙、混杂细菌、霉菌、寄生虫（卵）、重金属残余及其他杂质，并与冬虫夏草体表粘性极强的菌膜紧紧附着，手工清洁难以去除干净。
市场上销售的冬虫夏草大多只是适当地进行清洁，体表仍会有很多泥沙杂质存在。很多不法商贩还会将黄泥涂抺在冬虫夏草表面以增加重量，尤其是冬虫夏草的草头和虫体连接处，此种情况以指甲在连接处轻刮就会有很多泥土脱落。
还有一些商贩将冬虫夏草喷水增重。这种冬虫夏草手感潮湿，购买后贮存不当极易很快发霉变质。
这些增重方式常常会增加冬虫夏草30%-60%的无效重量，严重侵害消费者的利益。
由于冬虫夏草的造假手段层出不穷，所以导致即便是业内专家，在不借助专业仪器检测的前提下也无法准确判断是否有造假行为。