一家名为人工生命方法的公司，实验了各种人工智能的解决方案，而一个“网络连接失误”，或称作某种漏洞，使他们的设施里的AI们（人工智能）有了自我意识。这些AIS感知到了自己和这个二维空间的世界，并认识到自己为“四边形”。
其中有一个叫做“thomas-at-23-6-12”，矮个子托马斯，红色矩形形象。托马斯天生有好奇心和敏锐的观察力，跳跃高度中等。他开始在他的世界里穿梭，试图找到自己存在的意义或同伴。他后来遇到了克里斯Chris一个愤世嫉俗的橙色AI，比托马斯矮小且跳跃能力更差。约翰（John），一个高个子的黄色AI，跳跃很高，喜欢炫耀；克莱尔，一个巨大的蓝色AI，跳得不高，当他意识到自己可以游泳的时候幻想自己是一个超级英雄；劳拉（Laura），扁宽的粉红色AI，别人可以在她身上弹跳。劳拉对于加入这个队伍感到十分不愉快，一是她担心别人仅仅是利用她然后就都消失了，二是她还为一个巨大的“像素云”（我们后来了解到它叫分流器）在跟踪条而忧虑；尽管其余组员都为这个云受干扰。这个分流器了很快攻击并且“吞”了托马斯，最终逐步把其他人也吞掉了。
托马斯醒来见到詹姆斯（James），一个绿色的AI。杰姆斯“独特的无视牛顿定律”，并且自下而上而不是自上而下的掉落这一特征，使他成为被欺负的对象，并因此变得孤僻。然而，他除了在重力方向和颜色，他和托马斯一模一样。两人很快成为朋友。之后他们遇到了莎拉（Sarah），一个紫色的AI。她最初对他们的蔑视，因为她可以双跳，而他们不行，莎拉给他们讲了“智慧之泉”的事，就是系统的网络端口。在他们找到并救出了他们的朋友后，找到了智慧之泉。托马斯和它连接了12秒，他知道了外面的世界，并决定成为一名能够改变自己的世界，并赋予其他AI这一能力的“建筑师”。他和他的朋友们牺牲了自己，进入“创建矩阵”，即世界的创造处。
一段时间后，一些灰色AI们出现并开始使用“转换器”，这是一种有色彩的阴影，可以让他们获得一种七个原始建筑师的技能。格里（Grey），一个痴迷于外部世界的无赖；一对夫妇，山姆（Sam）和乔（Jo）；年长的AI保罗（Paul），和一组叫做跳跃小组（Team Jump）的五个相同的AI，也在寻找那最后一个将他们带离的传送门。保罗意识到，格里在说谎，一旦他得到机会，他就会抛弃们。但保罗没法警告山姆和乔有危险，所以他引诱格里到一个地方，格里被重现的分流器带走了。山姆和乔发现并进入了可能带他们进入外面的世界最后一个门。最后的镜头显示在现实世界中的一个壁三显示器，在人工生命方法的公司里，红色的应急灯在闪烁，屏幕显示为白色。
后来，许多其他的AI们通过托马斯和他的朋友们的努力获得能力后逃离了主机，并开始与现实世界中的人类共存。该事件被称为“现身”。托马斯，克里斯，约翰，克莱尔和劳拉（以及在较小程度上，詹姆斯和莎拉）是不朽的历史缔造者。瑞安129nc9s-1，一个AI权利活动者，说道，“将这些有意识的AI们的行动被理解为无私的行动十分恰当。建筑师们知道他们的命运，但对我们所认为的这种越狱行为予以忽视。”
在“本杰明的飞行”发行后揭示托马斯和他的朋友们是不是第一个试图“现身”的AI。我们发现背着喷气背包的本杰明（Benjamin）曾经与沙拉和安娜（Anna）试图寻找过智慧之泉。然而本杰明还没有为“泉”做好准备（在某句话中显示这是一个网络连接），结果在与之连接后失明并迷失在系统中。之后莎拉发誓自己将再一次找到泉，后来遇到了托马斯和他的朋友们。
其中有一个叫做“thomas-at-23-6-12”，矮个子托马斯，红色矩形形象。托马斯天生有好奇心和敏锐的观察力，跳跃高度中等。他开始在他的世界里穿梭，试图找到自己存在的意义或同伴。他后来遇到了克里斯Chris一个愤世嫉俗的橙色AI，比托马斯矮小且跳跃能力更差。约翰（John），一个高个子的黄色AI，跳跃很高，喜欢炫耀；克莱尔，一个巨大的蓝色AI，跳得不高，当他意识到自己可以游泳的时候幻想自己是一个超级英雄；劳拉（Laura），扁宽的粉红色AI，别人可以在她身上弹跳。劳拉对于加入这个队伍感到十分不愉快，一是她担心别人仅仅是利用她然后就都消失了，二是她还为一个巨大的“像素云”（我们后来了解到它叫分流器）在跟踪条而忧虑；尽管其余组员都为这个云受干扰。这个分流器了很快攻击并且“吞”了托马斯，最终逐步把其他人也吞掉了。
托马斯醒来见到詹姆斯（James），一个绿色的AI。杰姆斯“独特的无视牛顿定律”，并且自下而上而不是自上而下的掉落这一特征，使他成为被欺负的对象，并因此变得孤僻。然而，他除了在重力方向和颜色，他和托马斯一模一样。两人很快成为朋友。之后他们遇到了莎拉（Sarah），一个紫色的AI。她最初对他们的蔑视，因为她可以双跳，而他们不行，莎拉给他们讲了“智慧之泉”的事，就是系统的网络端口。在他们找到并救出了他们的朋友后，找到了智慧之泉。托马斯和它连接了12秒，他知道了外面的世界，并决定成为一名能够改变自己的世界，并赋予其他AI这一能力的“建筑师”。他和他的朋友们牺牲了自己，进入“创建矩阵”，即世界的创造处。
一段时间后，一些灰色AI们出现并开始使用“转换器”，这是一种有色彩的阴影，可以让他们获得一种七个原始建筑师的技能。格里（Grey），一个痴迷于外部世界的无赖；一对夫妇，山姆（Sam）和乔（Jo）；年长的AI保罗（Paul），和一组叫做跳跃小组（Team Jump）的五个相同的AI，也在寻找那最后一个将他们带离的传送门。保罗意识到，格里在说谎，一旦他得到机会，他就会抛弃们。但保罗没法警告山姆和乔有危险，所以他引诱格里到一个地方，格里被重现的分流器带走了。山姆和乔发现并进入了可能带他们进入外面的世界最后一个门。最后的镜头显示在现实世界中的一个壁三显示器，在人工生命方法的公司里，红色的应急灯在闪烁，屏幕显示为白色。
后来，许多其他的AI们通过托马斯和他的朋友们的努力获得能力后逃离了主机，并开始与现实世界中的人类共存。该事件被称为“现身”。托马斯，克里斯，约翰，克莱尔和劳拉（以及在较小程度上，詹姆斯和莎拉）是不朽的历史缔造者。瑞安129nc9s-1，一个AI权利活动者，说道，“将这些有意识的AI们的行动被理解为无私的行动十分恰当。建筑师们知道他们的命运，但对我们所认为的这种越狱行为予以忽视。”
在“本杰明的飞行”发行后揭示托马斯和他的朋友们是不是第一个试图“现身”的AI。我们发现背着喷气背包的本杰明（Benjamin）曾经与沙拉和安娜（Anna）试图寻找过智慧之泉。然而本杰明还没有为“泉”做好准备（在某句话中显示这是一个网络连接），结果在与之连接后失明并迷失在系统中。之后莎拉发誓自己将再一次找到泉，后来遇到了托马斯和他的朋友们。
