淀粉粒在考古中的应用主要在石制品功能分析和农业考古两个方面。首先淀粉是葡萄糖分子聚合而成的长链化合物，以淀粉粒的形式贮存在植物的根茎以及种子的薄壁细胞质中，淀粉在积累的过程中会形成淀粉粒的核心，被称为脐点，围绕脐点由内向外沉积会形成层纹。脐点的形状有点状、线状、分叉状等，一般位于中央的有小麦、蚕豆等，偏向一端的有马铃薯和藕。其次淀粉粒在形态上包括单粒淀粉、复粒淀粉、半复粒淀粉，根据不同的植物淀粉在形态、类型、大小、脐点上有不同的特征。最后淀粉粒应用在石制品功能分析上主要是通过微痕分析，通过植物残留物来判断石器的功能，比如在河北徐水南庄头遗址发现的类似于砧板的石制品，可以通过缝隙里的残留物来推断该石器是否为研磨器或者是研磨了哪种植物。
