如果科目余额表上有主营业务收入未报税，需要按照以下步骤录入期初余额：找到会计科目——“主营业务收入未交税款”；根据实际情况，确定该科目的期初余额；在会计软件中，打开“录入期初余额”功能，选择该科目，并填写期初余额金额和对应的日期；点击保存或确认按钮，完成期初余额的录入。需要注意的是，在录入期初余额时，应该仔细核对余额的正确性，并在会计凭证上注明期初余额的来源和计算方法，以备未来审计和核对。同时，在后续的会计处理中，应当及时将该科目的相关业务进行核算，并及时上报税务部门进行缴税，保证公司的财务合规性。