几年过去了，柯南和赤井再小哀的指引下毁灭了组织。而小哀也研制出了APTX4869的解药。在柯南变回工藤新一的当天。“你决定要离开吗？”工藤略显急躁得道。“是的。”小哀那低沉而冷静的声音缓缓响起。“留下来可以吗？我不想你走！”工藤紧接着说。“为什么？给我个理由。”哀的声音响起。“因为……”工藤犹豫了。随后他坚定地说：“因为我喜欢你，我离不开你。”“呃……”哀愣住了。“你是在开玩笑嘛？”哀的表情很古怪，七分惊喜再加上三分难以置信。“我是认真的。”工藤笑了，笑得很真诚。“工藤……”良久无言之后，哀再也压抑不住眼中泪水与心中的激动，紧紧地抱住工藤。“那毛利怎么办呢？”哀突然问了一句。“她会理解的。”工藤愣了一下，随后说。“现在我只想问一句，志保嫁给我好吗？”工藤紧紧地抱住志保的腰坚定的说。“如果小兰那边没问题的话，我愿意。”志保有些吃惊，随后微笑着说。“太好了，志保我爱你！”工藤兴奋地跳了起来。
　　几天后，工藤找到了小兰。“小兰，我们分手吧。”工藤目光有些歉疚的对小兰说。“是因为小哀吧。”小兰的声音有些颤抖，但没有丝毫豫。“呃……”共同明显有些惊讶。随后问到：“你怎么知道的？”小兰没有直接回答他，转而问道：“你就是柯南吧？”虽是疑问却十分肯定的语气令工藤有些不知所措，“原来你早就知道了。”但工藤很快就冷静了下来转而答道。随即又紧接着问到：“能告诉我你是什么时候知道的吗？”“在第一次看到你的时候就隐约明白了。”小兰的声音有些羞涩。“啊……那你还……”“还搂你.抱你.和你一起洗澡是吗！”小兰满脸通红的吼道，随后她哭了哭得撕心裂肺。“难道你还不明白我的心思吗？”小兰抽噎着问到。“我……”工藤沉默了。“你的心思我怎能不明白呢？”工藤苦笑道。“但感情是不可以勉强的，我想你能理解的，对吗？兰”工藤苦笑着说。“我明白，强扭的瓜不甜，我不会再留恋你这个负心人了。”兰流着泪哼到。“那么祝愿你能找到属于自己的幸福。”这次某新无奈了。
几天后，新一帮志宝办理了入学手续，两人携手走进了学校的大门，却引起了轩然大波。园子狂怒着为小兰打抱不平，某新落荒而逃。志宝更是无奈，哈弗大学颁布的博士证书，证明她是一个十八岁的女博士，人气极高，再加上她身为混血儿的那美丽无双的容颜和堪称完美的身材，帝丹的男生们疯狂了。新一自豪无比，却也十分无语，自豪在于如此完美的妙人儿，是自己的爱人，无语的是，自己爱的人为