肠道除了影响我们的消化系统，其实和我们的情绪、精神状态也密不可分，这也是为什么我们焦虑时会感到食欲下降或者暴饮暴食的一个原因。病原菌和抗生素可能会破坏肠道的正常功能，影响微生物-肠-脑轴的正常调节。
随着对微生物-肠-脑轴这一抑郁症潜在的病理基础深入研究，发现益生菌治疗成为抑郁症的潜在治疗方法。益生菌是指有助于肠道微生物平衡并有利于个体健康的活性微生物，常见的有乳酸杆菌属和双歧杆菌属。益生菌能够维持肠道免疫稳态，促进个体正常发育，并缓解压力、焦虑等负面情绪。具体而言，益生菌能够产生和传递神经活性物质，如血清素和γ-氨基丁酸等，这些分子信号作用于微生物-肠-脑轴后能够减少患者的抑郁情绪，改善认知能力。越来越多的研究表明，口服益生菌可以作为抑郁症等精神疾病的辅助疗法。研究中用于治疗的益生菌包括短双歧杆菌、长双歧杆菌和乳酸片球菌。希望所有精神科医生能重视益生菌（双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊等)在精神疾病治疗中的重大意义和作用，尽快运用到精神病人治疗中去！！该类菌常被医生用于配合治疗病人便秘的肠道功能调节中。