宇文逸大战叔叔后，渊国大军撤军了，宁国也由李元兴驻守边关三年，两国百姓都过上一段美好的生活。然而好景不长，三年后沿海海贼大举入侵，以柳生家武士和伊贺家忍者为主。渊国再出王者试图再次染指中原，宇文逸为首的天机门也做出了行动，三智再次因为种种原因再次聚首，碧波门也因有不少女子无辜失踪，牵连出一个移花宫的女性江湖组织，潜伏在黑暗之中的暗狱门蠢蠢欲动，冷月的飞鹰门令再次出现