在酵母单杂交实验中，如果转录因子连接 pb42ad 载体时没有去除终止密码子，可能会影响后续报告蛋白的表达。
一般来说，去除转录因子的终止密码子是为了确保转录因子与报告基因能够形成融合蛋白，从而使转录因子能够激活报告基因的表达。如果未去除终止密码子，转录因子可能无法与报告基因正确融合，从而影响报告蛋白的表达。
然而，具体情况还需要结合载体的特性和实验设计来综合判断。从你提供的 pb42ad 载体图谱来看，需要仔细分析载体上的元件和结构，确定终止密码子的存在是否会干扰转录因子与报告基因之间的连接和功能。
如果不确定是否会有影响，你可以考虑以下几种方法：
1. 查阅相关文献：查找其他研究者在使用 pb42ad 载体进行酵母单杂交实验时的经验和做法，看是否有关于去除终止密码子的讨论。
2. 进行对照实验：设置一组去除终止密码子的转录因子连接 pb42ad 载体作为对照，与未去除终止密码子的实验组进行比较，观察报告蛋白的表达情况。
3. 咨询专业人士：向有经验的实验室成员、导师或相关领域的专家请教，他们可能能够根据你的具体情况提供更准确的建议。
总之，在进行酵母单杂交实验时，需要仔细考虑各个实验步骤的影响因素，以确保实验结果的准确性和可靠性。