两代设定上隔了20多年

整体确实是没有什么明显关联，只是二代的设定是在一代结束的十年后
一代弗里曼打败boss尼赫伦斯，解放了Xen，然后被Gman囚禁
后来因为Xen被解放，幕后的始作俑者联合军发现了地球，于是侵略了地球
二代弗里曼在沉睡中醒来，故事在地球被联合军统治的多年后，起义反抗联合军

原定HL1与HL2之间相差20年，后来也有人说是10年前。
整体来看，HL1主角打败尼赫伦斯，解放xen弗地冈人，最终被gman束缚。
HL2主角被唤醒，联合军统治了地球，奴隶人类，而且弗地冈人也加入了人类阵营，共同抗击联合军势力。
HLA是在HL2的5年前（现实时间应该是EP1-EP2期间），这部主角是Alyx（爱莉克斯·凡斯），在HL2出场（在EP1-EP2系列是重要角色，主角戈登弗里曼和alyx一起逃离c17）。
整部游戏主题都是“生命被束缚，包括我们的主角”，因此剩下“半条命”。