辽宁水利部门事业单位改革后，部分单位被划分为公益二类事业（经费自理），包括辽阳灯塔灌区服务中心。这样的划分是根据国家政策和地方实际情况确定的，旨在推动水利事业的可持续发展和规范化管理。