先上结论：
1、技能杂志的本质是升级perk
2、周目内同名杂志不重复升级
3、多周目同名杂志可继续升级，同时本周目内不重复。
4、追踪者入门指南04无法获得的解决方案：归一后去红里拾取追踪者入门指南03，可获取5级perk能力。
首先wiki上对于杂志机制的介绍：
Magazines provide permanent perks after being picked up. They are listed under the notes section of the inventory. Most magazines work on a "rank" system, where you receive an additional rank of the perk list for each issue you find. Therefore, even if you find issue #5 first, you will receive the listed 1st rank of the perk.
简单来说，每一种技能杂志相当于解锁一个perk。该perk每等级的效果是固定的，并通过拾取该系列杂志【依次解锁】。这也就解释了为何同样一本杂志，不同人获取后解锁的技能不一样。
本文对于杂志机制的补充：
1、已经解锁过的杂志在本周目内与拾取时解锁的效果绑定，再次拾取同名杂志不会重复升级该类perk。
2、归一后杂志与效果说明绑定取消，同名杂志可以继续升级该类perk。
先说同名杂志周目内不可重复升级perk的问题。

我这里一共有11本矿业月刊，10期有两本。从获取顺序上来说，第二本10期的获取时间比最后几本要早。拾取时的物品介绍也出现了+2%伤害的说明。但此时看统计页面的杂志数是没有增加的。而最后拾取的第十本杂志依旧有效果提升的说明，尤其可见，周目内同名杂志并不能重复升级perk。即，周目内无需收集重名杂志。
再看多周目下的情况

左上角是我归一前的群星杂志拾取情况。归一后直奔陋室拾取群星01，可见此时杂志的技能对应的是4级群星perk的+5%哨站产出。由此可见，归一后杂志被重制，可以继续升级该系列perk。
由此推论出现阶段无法用正常手段获取的追踪者入门指南04的解决方法

只需要新周目跑去红里，拾取上就可以达成技能升级啦，统计信息里也是计算在内的。
另，感谢瓦鲁狂徒的帖子：星空技能杂志位置整理，想收集105杂志的可参考。随并感谢absabs007在回帖中对于疑难杂志的收集整理。