答案没有it ， where。如果有的话，我真的不知道怎么选，也不知道可对。至于也没有in，应该没有，因为主句有in the desk，如果没有in，后面补上。can it be the desk that you put in my letter？

句末有 in 的话，那 A 也是对的了。

强调状语
in已经搁前面了

这题应该是 which that where 都可以的， 前面已经有in 。 desk后面的关系代词其实是做名词性从句的引导词，这里是非限制性从句特指那个桌子，但我不清楚为什么可以用that。 而且非限制性定语从句应该要用逗号隔开，而不是用分号。出题人只知道that面前不能有逗号，但不知道that不能引导非限制性从句，这题纯属为了搞it be that强调题型折磨考生的。 搞得不伦不类。
不知道我说的对不对，有错請指出

你把句子还原就知道了，you have put my letter in the desk, can it be?

第一个空必须用it,第二个空可以是in which ,也可以是that

desk前面已经有in了 后面不要in

所以没一个人知道这个句子其实在说啥嘛

it could be the desk that you have put my letter in
it could be the desk in which you have put my letter
it could be in the desk that you have put my letter