分离方法有以下几种：
差速离心/超速离心
根据外泌体的体积和物理性质将外泌体与样品中存在的其他材料分离出来。
密度梯度离心
样品在离心力的情况下，不同组分会沉降到它们的等密度区，从而实现外泌体与样品中其他成分的分离。
免疫磁珠
提取将免疫磁珠涂有受体分子的抗体，与样品一起孵育以形成复合物。利用磁场的吸引，诱导这些复合物的方向运动，以便从样品中分离外泌体。
色谱
根据样品中分子大小的孔径来分离，与低速离心步骤相结合。样品中的颗粒将根据其大小以不同的速率过滤。大分子会被洗脱，小分子将进入凝胶孔，保留在色谱柱中，洗脱后得到分离的外泌体。
试剂盒
市场上已出现各种外泌体提取试剂盒，过滤、空间排阻色谱法(SEC)、免疫夹心法、化合物沉淀等等。操作简便、无需超速离心，可获得高纯度和高回收率的外泌体—外泌体亲和提取试剂盒（EVlent)利用特异性磁珠捕获沉淀法，纯度高、完整性好、回收率高等特点，广受客户喜爱，并发表了不少高质量的文章！
外泌体沉淀试剂
将样品与试剂混合，形成网状聚合物网，捕获一定尺寸的外泌体，这些随后以低离心速度沉淀分离外泌体。