霉菌的繁殖方式主要有两种：孢子繁殖和有性繁殖。孢子繁殖包括无性孢子和分生孢子两种，无性孢子主要是通过分裂或萌发等方式产生，分生孢子则是直接从菌丝体上分离出来形成新的菌丝体。有性繁殖则是通过两个不同的菌丝体结合，形成新的菌丝体和孢子。