豚鼠按毛的长短可分为短毛、长毛和刚毛豚鼠3种。一般实验用豚鼠多为短毛际鼠。（1)英国种：亦称荷兰种。我国使用的多为此种封闭群。其特点是毛短而光滑，毛色有白黑、棕、灰、淡黄、巧克力等单色，也有白黑双色或白、棕、黑3色。此品种生长快，抗病力强，紧殖性能好。
（2）近交系：最广泛使用的近交系2和13是美国培育的近交系，1950年由美国国立卫生研究院（NIH）分赠给世界各地。毛色为黑、棕、白3色。对结核杆菌抵抗力强，具有结合的GPL-AB.1抗原，血清中缺乏诱发的迟发超敏反应因子。