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晶体结构的表征
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jmkghcym
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粉末X射线衍射(PXRD)和单晶X射线衍射(SC-XRD)的使用
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1楼
2023-01-16 16:49
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理论部分我就不细讲了,这只是个简单的我科普介绍。
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2楼
2023-01-16 16:50
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首先是我最常使用的单晶XRD。众所周知,只有缝隙、小孔或者障碍物的尺寸和波长差不多时才会发生衍射。X射线的波长范围为0.001-10纳米,其波长与成键原子之间的距离(约数十纳米)相当,因此X射线可用于研究分子的结构。
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3楼
2023-01-16 16:50
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要使用单晶XRD首先是需要长出单晶。个人感受来说,长单晶是这个实验中最难的也是最玄学的部分。我个人用的比较多的长单晶的方法是液相扩散法和直接蒸发结晶。
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4楼
2023-01-16 16:50
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有时候晶体长的太大也不好,大晶体往往有肉眼不可见的杂质、气泡和裂缝,甚至可能长成孪晶。一般只要肉眼可以闪闪发亮的小晶体就够了。
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5楼
2023-01-16 16:51
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肉眼可见的晶体还是太大了,所以需要用显微镜切成十几微米到一两百微米的大小,然后用loop环靠硅油的张力粘上去。
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6楼
2023-01-16 16:51
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显微镜
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7楼
2023-01-16 16:52
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显微镜下的某个有机晶体
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8楼
2023-01-16 16:52
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然后把装有晶体的loop环放在仪器上,有机晶体一般需要100K或者150K的低温冷却,通常使用液氮来冷却。这是因为X射线强度高,低温能防止晶体被破坏,以及减少分子的热运动。
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9楼
2023-01-16 16:55
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X射线的来源主要有两种,一种是在常用X射线仪上使用的,通过高能电子流轰击铜靶、钼靶和液态金属镓靶产生不同波长的X射线,其中使用的CuKα的波长为1.5418Å另一种就是利用同步辐射所产生的X射线,其波长可以变化。我学校附近就有同步辐射光源,经常有人去那里做实验。
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10楼
2023-01-16 16:56
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常用的仪器有bruker的双靶X射线衍射仪,一般是铜靶和钼靶,多数高校都会有,多用于无机晶体和简单的有机晶体。但我用的不多。图中就是双靶XRD。
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11楼
2023-01-16 16:57
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我用的最多的是液态金属镓作为靶材的液态靶XRD仪器。优点是X射线强度高,分辨率高,可以用于复杂的有机分子和蛋白质分子,晶体小到十微米也能使用。缺点是价格高,据说目前全国只有十几台。有幸我们学校有一台,我也经常使用这台仪器测定有机分子的结构。下图就是液态靶。
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12楼
2023-01-16 16:58
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放上晶体并降到足够的温度后,就可以开始衍射。产生衍射的是晶面,当光程差等于波长的整数倍时,晶面的衍射线将加强,才能看到衍射点,根据布拉格方程2dsinθ=nλ,d是晶面间距,最小能看的d可以当成这次实验的分辨率,θ是入射角,n是正整数,λ是X射线的波长。此时得到的衍射图样是倒易点阵的一部分。下图是某个有机单晶的衍射图。
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13楼
2023-01-16 16:58
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这种每个衍射点都是独立分明的说明是单晶。如果单晶性差,得到的衍射就不是一个点,会有多个点同时出现,甚至出现一个衍射环,可以参考我之前的一个贴子里的图。
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14楼
2023-01-16 16:59
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整个操作过程比较复杂,我就不详细讲了。经过十几分钟到一个小时的衍射就可以了(双靶会久很多),然后对数据进行积分然后还原,得到数据。一般是使用olex2进行晶体结构的解析,可以直接得到分子中每个原子的种类和位置,可以用来判断手性和绝对构型,以及判断未知的产物。单晶XRD能最直观的看到分子长什么样,比如下图甚至可以看出分子内N和H之间的氢键。
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15楼
2023-01-16 17:00
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