骇鲎科
骇鲎亚目仅有一科
共有3个亚科
骇鲎亚科
这是它们之中最基干的类群，拥有上述的洄游习性，某些种类有纯淡水的种群，该类群体长在80厘米到4米之间，灭绝于1亿年后复眼位于身体的两侧和前方
大眼骇鲎亚科
出现于7000万年后，习性和骇鲎亚科类似，但在成体后白天在暮色带，到了夜晚会来到海面，通常会捕食较大的鱿鱼，，复眼位于身体前方，腹部有一些纤毛，可以感受到下方的危险，灭绝于1.8亿年后
阿拉伯鲎亚科
这是因为地质原因被困在某些在未来出现于阿拉伯地区的大型咸水湖泊的类群，出现于6000万年后，在7000万年后由于该湖泊的消失而灭绝，习性和骇鲎类似

阿尔维蒂亚目
这是一种接近骇鲎样貌，出现于4500万年后，由厚头鲎科演化而来的叠鳃鲎
它们是整个异鳃亚纲存活时间最长的类群之一，存活至3亿年后
有两个超科
扁体鲎超科
出现于4500万年后，拥有类似鳌虾的生态位，最大体型65厘米，岩体鲎
其中岩体鲎在内的部分物种会拟态为礁石
灭绝于3亿年后
凯旋鲎超科
出现于4500万年后，为远洋类群，最大体型7米物种为帚棘凯旋鲎
该类群外观类似于加长版厚头鲎科，腹部有大量的游泳肌肉
灭绝于1.6亿年后的缺氧事件