司马衍虽然年幼，但是代表了中央政府，尤其是各民族对司马氏仍是忠诚，晋人不因为司马衍年幼就叛离晋朝，加上辽东慕容廆，代王翳槐仍忠晋，即使羯族也没有僭越帝号，仍称晋藩，羯族政权中虽然军队主要是羯族将领，但是文官几乎都是晋人，而且太傅、司徒裴宪是公开忠于晋朝，石苞后代石璞被当成宗室，羯族在表面不得不尊晋，羯族首领长期仅称王，不僭越帝号。在羯族和匈奴在洛阳附近的决战中，各自统帅八千骑兵担任先锋攻击的石堪和石聪都是晋人，被羯族任命为攻击匈奴的主力先头部队，另一员大将石瞻也是晋人，是原乞活军将领，即使是最后攻灭匈奴的石虎，也曾被晋军俘虏，后来被释放，在羯族和匈奴决战中，最终俘虏匈奴头领的是晋人石堪，晋人在平定匈奴的战争中，仍是发挥了决定性作用。司马衍在江南虽然没有直接出征，但是发挥的影响是非常重要的，他是晋朝中央政府的标志，北方晋军各部不论是凉州张氏、幽州的段氏、辽东平州的慕容氏、草原代王拓跋氏、雍州刺史魏该、西域长史李柏、戊己校尉赵贞、仇池杨氏、吐谷浑部吐延等，都是把晋朝和司马衍作为中央和首脑，正是这样的社会状况，决定了平定关中匈奴的战争，实际是司马衍领导的晋朝中央政府反分裂的战争，当时忠于晋朝中央的晋人和晋藩控制九成领土，僭越称帝的匈奴控制区域很小，而且控制时间仅十年，就被晋军联合各民族平定了。另一僭越帝号的氐族政权也是转而亲晋，凉州张骏派傅颖要假道去京师朝晋，李雄不同意，再次派张淳到氐族割据那里，张淳就劝说氐族归晋，李雄也表示自己父祖都是晋臣，晋朝中央若收复中原，自己就辅佐司马衍，也同意让张淳从益州到京师朝见司马衍，所以在司马衍时期，晋朝不仅平定了匈奴的分裂割据，也巩固了晋朝中央地位。羯族虽然吞并了匈奴的地盘，领土扩大，首领从藩王提升了一级，称号晋藩天王，也有些自大，想再次南侵，攻克襄阳，僭越帝号，陶侃立即派兵北伐收复襄阳，并且和慕容廆通信联络共同攻打羯族，羯族才再次降号天王，遣使到京师纳币称臣，司马衍诏令焚毁羯族贡品，不久石勒卒，石虎夺权，羯族控制区的石聪、石堪、石生、蒋英、郭权等起义归晋，羯族控制区几乎一半领土都归晋。司马衍时代平定匈奴仅四年，就几乎再次恢复旧疆，收复中原，虽然最终羯族重新控制了关中等地，但是羯族经过这次起义，也不敢再次僭越帝号，石虎仍称天王，保持晋藩地位十多年。后来氐族另立政权改国号被晋朝平定，石虎临终前称帝，羯族陷入内乱，晋朝平定了羯族，恢复旧疆，复兴统一。司马衍时代虽然没能复兴，但是平定匈奴，陶侃、毛宝、邓岳、谢艾、庾亮、慕容皝等北伐收复大部分领土，奠定复兴的基础。

司马衍是少年英雄，知人善任，领导反分裂复兴战争，任用贤臣，受到各民族拥护，平定匈奴取得反分裂战争转折胜利，推动民族复兴。