噬菌体在自然环境中的意义在于它们能够在宿主体内复制，从而影响细菌群落的多样性，在人体内，噬菌体的作用是保护人体免受致病菌的侵袭；海水中含有41030种病毒，这使其成为最大的噬菌体库；土壤噬菌体具有影响其养分循环及植物根系与细菌之间的共生关系的功能。在人工环境中，噬菌体介导细菌生长的能力可以被开发为多种用途，由于其特殊性导致它们可以轻易地被基因改造；在废水处理中，噬菌体可以用来影响现有的细菌群落，从而提高处理效率；在工业上，噬菌体的应用主要为控制食源性病原体和减少石油工业中问题细菌的数量。

农业工业医疗等产业

（1）未知病毒的发现
（2）特定病毒/噬菌体的检测分析
（3）病毒与农业生产
（4）土壤、病虫害、植物等
（5）细菌与噬菌体的互作
（6）肠道、皮肤、环境等
（7）病毒与健康关系研究不同遗传背景、不同饮食习惯、身体各部位等
（8）病毒与环境海洋、空气、公共交通系统、医院环境、冰川等
（9）病毒与疾病关系研究代谢病、胃肠道疾病、呼吸道疾病、过敏性疾 病、感染性疾病、口腔疾病、肿瘤
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