tv和剧场版设定是互相背刺的，硬要解释的话，就是巨人降临，先是齐杰拉开花，然后光之巨人不干涉人类回家去了，少数人用他们留下的躯体变成巨人，后来内战，内战后也不剩几个巨人了，被苏醒的加坦杰厄一波带走了

按剧场版设定，后来那些暗之巨人和光之巨人就是超古代人变得，所以用的是走掉的光之巨人的身体，不过由于互相背刺的设定，这里面细理是理不清的，只能给个大概说法，反正最后就是加坦带走了超古代文明，结果就是那么个结果，至于以前究竟发生了什么，哎嘿，三千万年前的事谁也不知道了，只知道大概发生了什么

剧场版和TV背景设定完全就不一样，从TV角度出发实则齐杰拉给人类带去没有痛苦和自卫能力最后加坦降临走向灭亡（TV45几乎是明示），而剧场版长谷川始终认为导致超古代灭亡的是大古（黑迪），现在什么黑迪毁灭超古代加坦捡漏都只能说是强行圆上的

TV版小中千昭 右田昌万VS剧场版长谷川圭一 右田昌万

齐杰拉开花→文明陷入混乱，黑暗怪兽出现→未被齐杰拉蛊惑的超古代人抗击黑暗→部分巨人堕落黑暗→巨人内斗→以迪迦为首的4个最强的黑暗巨人击败两方→迪迦弃暗投明打败3人组，幽怜封印露露耶→至此时，虽然封印了黑暗，但超古代人没有选择拒绝齐杰拉这个大患，同时地球发生了剧烈的地壳运动(这个过程中露露耶沉没海底)，多种因素共同作用导致文明无法重建，超古代人无奈彻底放弃地球，3位巨人为未来的人类留下了石像躯体
要梳理的话大概就是这么一个过程