某些三体粉把黑暗森林理论奉为真理，殊不知那只是刘慈欣虚构的一种假说，刘慈欣自己都不认为黑暗森林肯定是真理。
举个例子，刘慈欣另一部小说《朝闻道》里面的高级文明就不符合黑暗森林理论，那里面的高级文明也关注着若干初级文明，他们三亿年前就开始关注地球，但是一直不干涉地球文明，直到他们认为地球人的科学研究可能会导致宇宙衰变时，才以和平方式出面干预。按照黑森理论，他们应该一发现地球有文明就会消灭地球人类。