飞龙在中途岛海战中的载机是零战21架、九九舰爆21架、九七舰攻21架。
空袭中途岛的时候，5架97被击落。归舰后4架97和2架零战因为损伤过大不能继续使用。
飞龙的第二波攻击是10架97，6架零战。损失了5架97和3架零战。返回的5架97中，4架不能使用，1架经过修理后可以继续使用。
飞龙第三波攻击预备是10架零战，5架99，4架97。这样说起来，多出来的一架是从其他空母上接受过来的。