二次大战期间德国处于战争状态，柏林赫塔被纳粹党控制，而俱乐部主场更在1945年被敌军轰炸而毁。战后柏林赫塔由来自德累斯顿的球员和教练组成，因当时正值冷战，柏林赫塔亦受牵连，一度没法参与任何地区性联赛，后来改为参与西德联赛。