不是应该在反抗军总部里么？而且从那个废墟里摇摇晃晃走出来。桶子心真大。不怕胸针在废墟被军队给毙了？

游戏里是直接通过amadeus类似的方法移植记忆，但是动画里说是通过时间机器就不知道是怎么了

想不通很正常，毕竟原创剧情。原作是凶真2011年的记忆在amadeus实验中被真帆搞成了人工智能（参考AI助手），然后三战开战后凶真记忆的备份一直在敌人那里，凶真本体植物人了。 直至2036年，凶真的记忆在东京电机大的地下室被找到，然后桶子欺骗世界，让死了的凶真复活于2036,。而且从2036往回的时间跃迁是桶子和真帆计划的，原本并不是凶真的主意。我可能原作剧情说的太多了，其实我就是想说，动画里突兀的地方，大概是因为魔改而现编的剧情导致的。

其实也好理解，时间机器的原理就是将当前记忆复制，然后发送到过去进行覆盖粘贴。而动画里有明确交代当时不知什么原因导致时间跳跃失败，也就是时间机器只进行了记忆的复制，没有进行发送粘贴，也就是说当时凶真的记忆一直保存在时间机器里面。胸针活着的时候，没有人会在意这个，直到凶真意识奔溃死亡，估计才有人想起这么一回事。而如何将时间机器保存的记忆直接覆盖到凶真的身体里面，估计花了很长一段时间，同时进行了多次实验，这也是为什么凶真醒来时没有人在他身边的原因。