花木镇的境域范围最初确定于1959年5月林家人民公社(1959年9月改名为花木人民公社)建立以后，它位于东经121·32'30"，北纬31·12'25"，全境总面积约为12．74平方公里。
　　花木镇位于黄浦江东侧，是浦东冲积平原的一个组成部分，其形成，主要是由长江夹带来的泥沙在江海相互作用下不断堆积而成的，在其自西而东逐渐成陆的过程中，由于花木镇地处浦东的西部，因此其成陆时间在浦东地区是比较早的。
　　花木镇地区地势平坦，以吴淞高程为准，全镇绝大部分土地地面高程在3米至4．5米之间，平均为3．6米。本地区四季分明，气候温和湿润，雨量充沛，常年平均气温15．3·C，极适宜于农业。本地区人民自古即以农业为主。全境土壤经长期的耕作和培育，绝大部分由泥沙积而成的土壤由于熟化程度不断提高，已逐渐改良为肥沃的水稻土。其中有部分土地由于自明代起花卉苗木种植业的发展，又进一步改良成为更为肥沃的果园土。
　　花木镇地处上海市中心区东南部的市郊结合部，离上海市中心人民广场仅为7公里。由于其距上海市区的距离比较近，因此长期来其受上海市这座特大城市功能幅射的影响亦比较明显，特别是在最近的10年中，随着浦东开发开放的日益深入发展，和上海市区的日益扩展，从而促使花木镇的面貌发生了更为明显的变化。使花木镇由原来一个农业地区，逐渐地发展成为一个蔬菜种植区，并再由一个蔬菜种植地区逐渐地发展成为上海市城区内环线范围内城市化地区的一部分。随着该地区城市化进程的日益加快发展，这里原有的阡陌相连的广袤农田和星星点点散布于田野间的农舍庄屋，现在绝大部分都已成片成片地被通衢大道和连片的高楼华厦所替代，由农村而城市，从而也使花木镇地区的自然环境从此发生了显著的改观。
　　花木镇地处北亚热带南缘东亚季风盛行的滨海地带，属北亚热带海洋性季风气候，寒热空气交替中由于受海洋的调节，春夏秋冬四季分明，全年温和湿润。
　　花木镇地区是浦东平原的一个组成部分，位于黄浦江的东侧，属平原水网地区，境内河流纵横，沟渠池塘星罗棋布，水面广阔。