我们一般在书籍上或者杂志上对于红珊瑚为什么是红色的，较常见的通说是因为珊瑚生长在海中遇到铁离子，使的珊瑚变成红色的，尤其在台湾和日本一带的海底有着大量的火山运动，这些海底火山提供了火山灰物质，这些物质含有一些化学元素，在珊瑚钙化的过程中，如果吸附铁离子，则珊瑚就变成红色的；如果吸附镁的元素以及少许的铁离子，那么珊瑚的研究就会是粉红或者是粉白的；如果吸附的元素主要以镁为主，则成为了白珊瑚。此为色素离子致色说，主要是以铁离子为致色的主要成因。
而另外一种关于珊瑚致色成因的学说，则是金属卟啉致色说，该说认为珊瑚虫是一种海生腔肠动物，用自己的触手来捕捉食物，珊瑚虫从食物中摄取含有微量重金属的的元素和有机质蛋白色素中的卟啉结合成金属卟啉体，例如叶绿素就是镁和卟啉结合成的金属卟啉体、血红素就是铁和卟啉结合成的金属卟啉体。这些金属卟啉体在各种珊瑚内的含量不同造成珊瑚的颜色呈现出不同的颜色。因此当珊瑚受热会退色就是因为卟啉体受热分解的缘故。而化学成分和珊瑚同样为碳酸钙的珍珠，在许多学者用拉曼光谱仪对珍珠曾进行研究分析后，得出结论是，关于珍珠的致色成因，就是因为珍珠层中的类胡萝卜素和金属卟啉的相对浓度影响了珍珠的成色。
第三种则是有机质成色说，在阐述这个学说之前，我们要先来了解到何谓有机化合物，意旨含碳化合物（一氧化碳、二氧化碳、碳酸、碳酸盐、金属碳化物、氰化物除外）或碳氢化合物及其衍生物的总称。
而类胡萝卜素Carotenoid是一类四萜烯（即分子中包含40个碳原子, 由4个萜烯基团而来，每个萜烯基团包含10个碳原子，或者说8个异戊二烯基本单位构成），也是有机化合物的一种。人类与其它动物基本不能合成类胡萝卜素，必须从食物中获得，类胡萝卜素是动物的一种常见的，常常是修饰性特征。例如，粉红色鲑鱼,煮熟的龙虾的红颜色，都是由于类胡萝卜素。
有机化合物致色说，主要再讲这些化合物的分子结构中的电子能够对可见光产生选择性吸收。对于阳光的照射，如果化合物的吸收全部波长的光就会呈现黑色，如果化合物完全不吸收可见光的波长而是全部反射就会呈现白色，如果化合物选择可见光中的某一段光，透过反射其他波段的光，那么化合物就会呈现所吸收的光的颜色。所以化合物的分子结构是影响颜色的主因，因为分子结构决定了他会吸收哪些光，或者是对哪些光反射。
此一学说讲的就是珊瑚也就是碳酸钙的电子，选择了吸收了红色的可见光且反射了其他颜色的光，因而呈现出红色。
上述两种关于珊瑚致色成因的推测，在学术界并无定论，谨以此三种学说作为参考。泰山哥微信1083268更相信蛋白质致色说，未为此还专门做了实验，烧了几颗阿卡、momo、沙丁的珠子，确实高温下红珊瑚会蜕变为白色，友情提醒这个过程不可逆，可以直接找我要照片看