本人觉得他们的关系并不是很重要，只不过是为避嫌(时代所限)所用的一个引子而已。
之前看见有好些人在不停地争辩他们之间的关系，也许只是出于娱乐的目的。下面我说说我的看法。
第一章中这样写道：只因当年这个石头，娲皇未用，自己却也落得逍遥自在，各处去游玩，一日到警幻仙子处，那仙子知他有些来历，因留他在赤霞宫中，名他为赤霞宫神瑛侍者。他却常在西方灵河岸上行走，看见那灵河岸上三生石畔有棵“绛珠仙草”，十分娇娜可爱，遂日已甘露灌溉，这“绛珠草”始得久延岁月。……他若下世为人，我也同去走一遭，但把我一生所有的眼泪还他，也还得过了。因此一事，就勾出了多少风流冤家都要下凡，造历幻缘；那“绛珠仙草”也在其中，今日这石正该下世……
如此看来，宝玉的灵魂，石头，侍者只是同一事物的三种不同表象，DNA是相同的。
石头修炼有了侍者这个身份，侍者是石头灵魂进化版，但仍不足以投胎成人，于是二位仙人施法将其进化版的魂魄注入宝玉体类，至于为何还要带着玉，我想虽然其进化了，但其根本仍然在石内，二者相辅相成，哈哈。
还有，据原文推测，石兄下凡此事仙界已“发文”，二位仙人只是暗中引导。一来了却人情债，而来是“重用”前的历练，等宝玉的灵魂归天后“侍者”立马就升职了