根据中国科学技术信息研究所公布的数据，该校被《工程索引》（EI）收录论文数，连续17年保持全国高校首位；被《科学技术会议索引》（ISTP）收录论文数，连续22年保持全国高校首位，被《科学引文索引》（SCI 网络版）收录论文，在数量保持稳定的同时，质量有稳步提升，SCI论文被引用篇数及被引用次数继续在全国高校名列前茅。
　　该校2009年度国际论文被引用3766篇，共计13314次，被网络版《科学引文索引》（SCI）收录的总数为2758篇，被《工程索引》（EI）收录的论文数3431篇，被《科学技术会议录索引》（ISTP）收录的论文1377篇，被《社会科学引文索引》（SSCI）收录的论文数为83篇。
　　2009年该校共发表各类学术著作165部，2010年该校共发表各类学术著作138部。2009年该校共出版人文社会科学类学术著作268部，2010年该校共出版人文社会科学类学术著作261部.
　　《清华大学学报》：《清华大学学报（自然科学版）》、《Tsinghua Science and Technology》、《清华大学学报（哲学社会科学版）》。
　　《世界建筑》：国家一级杂志和建筑科学类核心期刊。
　　《装饰》：国内艺术设计类唯一的核心期刊。
　　《清华法学》：由中华人民共和国教育部主管，清华大学主办，清华大学法学院《清华法学》编辑部编辑，双月刊，逢单月15日出版。
　　《清华大学教育研究》：是全国《中文核心期刊要目总览》"核心期刊"，中文社会科学引文索引（CSSCI）核心期刊，在国内外学术界享有很高声望。