1 、疏枝 。首先要剪去死枝、伤枝、病虫枝、针刺枝和横穿枝，而后疏除过密的结果枝，疏剪结果枝时，先去背下枝、细弱枝，后去背上枝、中间枝，如果还密，再疏两侧枝，剪后使果枝间距为5-6厘米。
2 、处理徒长枝 。生长在骨干枝下垂处的徒长枝，留作骨干枝的延长枝，并适当短截，使枝势和延伸方向稳定；徒长枝附近有空间的适当短截，培养成结果枝组，扩大树冠，增加结果面积；无利用价值的徒长枝，从基部剪掉。
3、 更新复壮结果枝组 。枸杞结果枝组结2年果后多弯曲下垂，结果能力下降，对这种结果枝组，留3-5厘米短截，春季发芽后，选一生长方向位置合适而且健壮的芽，通过摘心，培养成新的结果枝组。
4、更新培养结果枝 。结果弱的果枝特征是枝条成灰褐色，极短枝很明显，对这种果枝必须及时短截更新。一般从果枝弯曲下垂处剪去，粗壮的短剪1/2，弱的短剪2/3，过弱的只留5-6厘米短截，短截程度宁轻勿重。
5、适时修剪 。枸杞枝条如修剪过早，剪口处易失水干枯，不易愈合，所以应在春季树液开始流动前完成剪枝，并掌握老弱树早剪、幼弱树晚剪的原则。