古琴的内涵中是不是有很多后人牵强附会的东西？

我认为是附会。
十三徽也不是因为十三个月才定的十三徽。只是正好十三个强泛音点，让人想到了十三个月，就附会上去了。
宫音和商音也并不是因为君臣才定的音高，君臣和音高没有任何关系。
还有琴的尺寸和一年的天数的关系；天圆地方等等东西。

应该不是牵强附会，古人本来就喜欢玩弄玄虚，或许就是这样的思路设计出古琴，然后再加上那种文风，创作了许多古琴曲。

加点文化内涵是古人常干的事

汉服也同理~但是因为这些“附会”的东西使得这件物品多了几分沉淀。

不能说是牵强附会，那个牵强附会那嚒容易去牵强去附会啊，
应该是共生的，相辅相成，首先客观的说肯定是乐器本身的物理性质，决定它的音域音色等等，至于古琴中融入的一些思想那也是古人在造琴是刻意去追求的结果，也不排除有巧合的事情。

除了那个十三个月，我觉得其他没什么牵强附会吧。
古人定义成这样主要是中国自古就有万物皆有灵的说法。——个人理解

有些是古人的智慧，也有些是附会