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血管浸润是肝细胞癌(HCC)患者复发和不良预后的独立危险因素，血管浸润常分为大血管浸润和微血管浸润 (MVI)，肝移植术后，有MVI的患者复发风险增加了四倍以上。目前术前影像学尚不能发现潜在的微观血管浸润，且HCC血管浸润的分子机制在很大程度上是未知的。识别与血管浸润相关的分子突变特征将有助于确定HCC的新治疗靶点并预测复发风险。 近日，南方医科大学南方医院运用桐树基因检测技术，于2022年7月在 Journal of Gastrointestinal Oncology（IF=2.587）

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肿瘤这个大杀手，至今依然是人类健康的巨大威胁。人们孜孜不倦地探索，却依然没有解开它的全部秘密。但至今的研究，已经让我们了解到肿瘤是一个具有强烈时空异质性的细胞集合，也提供了许多工具，帮助我们分析这些异质性。对瘤内异质性的分析，能帮助医生为患者制定更好的治疗策略，让他们更可能恢复健康。http://phoenix.tongshugene.net 1. 肿瘤的异质性 分子诊断和测序技术的发展已经帮助我们理清了许多癌症复杂的遗传组成。在人群中，肿瘤

肿瘤克隆进化分析的原来啥？什么是肿瘤克隆进化分析？

01背景 本研究旨在构建预测头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者CD27表达水平的放射组学模型。Cancer Genome Atlas和Cancer Imaging Archive下载HNSCC患者的基因组数据和对比增强计算机断层扫描(CT)图像，用于预后分析、图像特征提取和模型构建。该研究探索了CD27表达的潜在分子机制及其与免疫微环境的关系，并预测了HNSCC组织中的CD27 mRNA表达。使用基于CT的非侵入性放射组学技术，生成了放射组学模型并评估了其与相关基因和HNSCC预后的相关性。 02方法 1. 医学影像数据和

01 背景 免疫球蛋白G4相关疾病（IgG4-RD）是一种病因不明的复杂免疫介导的纤维化炎症性疾病，可累及多个器官。它通常表现为受累器官中的亚急性肿块或弥漫性器官增大，易与肿瘤性疾病混淆，导致误诊。这些疾病的治疗方案和临床结局差异很大，因此迫切需要用于IgG4-RD诊断和鉴别诊断的生物标志物。 免疫细胞中的生物标志物参与抗体产生的细胞代谢，如浆母细胞和滤泡辅助性T（Tfh）细胞，特别是Tfh2细胞，在未经治疗的IgG4-RD患者中显着升高，并且

1. 概念 细胞自噬（Autophagy) ▪细胞自噬是指细胞在外界环境因素的影响下，细胞利用溶酶体降解自身受损、变性或衰老的大分子物质以及细胞器的自我消化过程。 ▪自噬是细胞的一种自我保护机制，广泛存在于真核细胞内；在调节细胞生存和死亡的过程中，起着重要的作用。 2.自噬类型 哺乳动物自噬可分为三种类型： ▪巨自噬 ▪微自噬 ▪分子伴侣介导的自噬 3.自噬过程 自噬过程，是一个连续的细胞学行为。可分为如下三个阶段： 双层分隔膜的形

今天为大家分享一篇22年11月分享在Frontiers in Pharmacology (IF: 5.988)杂志的文章。本文基于TGF-β信号通路相关基因对胃癌患者进行了二次聚类，并构建了TGF-β相关预后模型，建立风险评分。分析高、低风险组的预后、肿瘤突变负担(TMB)、肿瘤微环境（TME）、对免疫检查点抑制剂(ICIs)和抗肿瘤药物的敏感性等。方法和思路适用于其他疾病。 背景 目前，大多数研究只关注TGF-β信号通路中的一两个基因，而肿瘤的发生往往是大量基因相互作用的结果。因此，有必

背景 肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）是癌症相关死亡的第二大原因，在世界范围内的发病率不断上升。HCC主要通过手术（切除和移植）和/或多种辅助治疗联合治疗，但是HCC的患者的预后仍是不乐观的。已有研究表明，CD4+T淋巴细胞可抑制肝癌发生，介导肿瘤消退，CD4+ T常规淋巴细胞（CD4+ Tconv）在HCC中起关键作用。越来越多的研究表明，长链非编码RNA（lncRNA) 在包括HCC在内的病理过程中起着重要的作用。但是与CD4+ Tconv相关的lncRNA对于HCC患者的预后

背景 肝细胞癌（LIHC）是最具侵袭性的癌症之一。癌症统计数据显示，2020年全球有90.6万例新发肝癌病例和83万例死亡，75%-85%的肝癌病例类型为LIHC。在过去的几十年中，人们努力提高对LIHC的理解，据报道许多分子促进LIHC的启动和进展。例如，GOLM1可以通过调节EGFR/RTK细胞表面再循环来驱动LIHC转移，Hsp90α依赖性Bclaf1可以通过调节c-MYC mRNA稳定性来促进LIHC增殖。然而，仍然缺乏有效的生物标志物，LIHC的机制在很大程度上仍不清楚。 近年来，ZBTB蛋白是核转

背景 卵巢癌（OV）是世界范围内最常见的妇科恶性肿瘤之一，死亡率高且预后不佳。CC 基序趋化因子受体 5 型 (CCR5)在肿瘤侵袭和转移中发挥作用且与卵巢癌相关。CT 影像放射组学可用于卵巢癌患者的早期诊断、风险分层、残留病灶评估和肿瘤异质性，目前还没有涉及使用放射组学特征来对卵巢肿瘤患者生存分析及预测 CCR5 的表达水平并评估其预后价值的研究。 方法 1. TCIA 和 TCGA下载卵巢癌样本信息 2. 根据CCR5表达将患者分高低表达组，进行临床特征相

骨科-椎间盘退变 影响因子4.599 杂志：Frontiers in Genetics 周期：6个月 公共数据库挖掘+pcr验证

（生信分析+pcr）膀胱癌 影响因子4.5 杂志：JOURNAL of Oncology 投稿周期：2个月